■日時 ２０１８年 ７月 ５日（木） １０：００～１７：００《技術解説》および
６日（金） ９：３０～１５：００《技術実習》
■場所 ５日：大阪大学大学院医学系研究科講義棟 2階 第2講義室
６日：大阪大学 最先端医療イノベーションセンター(CoMIT) 2階 セミナー室Ａ
(共に大阪モノレール彩都線阪大病院前駅下車 徒歩５分程度、アクセス)
■趣旨
近年、機能未知のRNA結合タンパク質(RBP)が多く見つかるようになった。また、RNA結合タンパク質をコードする遺伝子に、様々な疾患関連変異が同定されるケースも増えている。このような場合、結合するRNAを網羅的に同定することが、機能の推定や疾患病態の解明に不可欠である。しかし、DNAと異なり、細胞中に多種多様かつ豊富に発現しているRNAの場合、RBPに真に結合するRNAを同定することには、一層の工夫が必要である。PAR-CLIP法は、RBPに結合するRNAを網羅的に同定できるだけでなく、結合部位を１塩基解像度で同定できる優れた手法である。本講習では、まずサンプル調整法について解説する。また、本手法は情報解析と組み合わせることが不可欠であり、結果の妥当性の検証方法を実習を通して体験していただく。HITS-CLIP法、iCLIP法、miCLIP法など類似の手法にも応用可能であり、講習の中で解説する。
■コーディネーター 河原 行郎 大阪大学 大学院医学系研究科 神経遺伝子学 教授
■プログラム
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技術解説 ５日(木) 10:00～17:00 |
１．PAR-CLIP法の基本原理 （河原） ２．PAR-CLIP法によるサンプル調整１（河原） |
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３．PAR-CLIP法によるサンプル調整２（河原） |
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４．PAR-CLIP法に必要な情報解析の概要と準備（加藤） |
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技術実習 ６日(金) 9:30～15:00 |
１．PAR-CLIP法に必要な情報解析実習１（加藤） |
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２．PAR-CLIP法に必要な情報解析実習２（加藤） |
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３．実習総括（河原、加藤） |
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講 師： 河原 行郎、加藤 有己 大阪大学 大学院医学系研究科 神経遺伝子学 |
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■参加対象 RNA結合タンパク質を対象とした研究に興味のある研究者。
技術実習にはMacOSを搭載したPCを使用します（メモリは8GB以上）。お持ちでない方には貸し出しますが、台数に制限がありますので、あらかじめお申し出ください。
（なお、実習時のPCの故障・破損・動作不良、ウイルス感染等について主催者は責任を負えません。予めご了解の上、お申し込み下さい。）
■定員技術解説（１日目）４０名、実習（技術解説と技術実習の２日間）２０名
■参加費技術解説のみ（1日目のみ）：2,000円、実習（技術解説と技術実習）：3,000円
■申込方法：財団ホームページよりお申し込みください。
■申込締切 平成３０年５月３１日（木）（財団必着）
■主催 公益財団法人 千里ライフサイエンス振興財団 事務局：秋山 雅央(このメールアドレスはスパムボットから保護されています。閲覧するにはJavaScriptを有効にする必要があります。)
〒560-0082 大阪府豊中市新千里東町１－４－２ (TEL 06-6873-2001)